פרויקט שביל ישראל הוא פרוייקט טבע-תרפיה מקיף הלוקח שנתיים, בו מרגע הקליטה במסגרת יוצאים בני הנוער למקטעים של שביל ישראל. היציאה למסע מתקיימת כל חודש וחצי למשך שלושה ימים עד ארבעה ימים בליווי צוות טיפולי. הפרוייקט מאפשר לנערים לעבור מסע עצמי של התמודדות אישית בתנאי שטח בסיסיים במטרה לספק להם חווית הצלחה, שייכות וגאווה. ההליכה בשביל ישראל ומגוון ההתמודדויות משמשים ככלי טיפולי דינאמי דרכו משתקפים תהליכים אישיים וקבוצתיים של הנערים. דרך המסע הנערים חווים תחושת העצמה ומסוגלות גבוהה התורמת לשיפור איכות חייהם.
היציאה האינטנסיבית לשטח ( 28 ימים בשנה) מאפשרת ליצור תהליך של למידה במספר מישורים.
הראשון הוא לימודי- הנערים לומדים על המקומות שבהם הם מטיילים, חוקרים סיפורי מורשת ורוכשים ידע בניווטים.
השני- חברתי- תהליך ההעצמה שקורה במהלך הפרוייקט הוא אישי וקבוצתי כאחד. כל נער מקבל תפקיד בתוך הקבוצה עם האחריות הנלוות ומתפקד כאחד מתוך חוליה שצריכה להגיע מנקודה א לנקודה ב.
פיסי- הנערים נכנסים לכושר, לומדים לאכול נכון, שומרים על איזונים סוכרים בדם.
קשר לטבע- הנערים מנקים את השבילים במהלך ההליכה, לעיתים עושים פרייוקטים מרוכזים של פתיחת שבילים ועדכון השילוט.